Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Ttc39dQ0VF76 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
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Ttc39dQ0VF76 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms