Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1278-206ENSMUST00000216229 6819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Siah1bQ06985 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms