Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mrgpra6-202ENSMUST00000186456 1090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm6187-201ENSMUST00000040649 960 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mrgpra6-201ENSMUST00000073793 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Clmn-202ENSMUST00000109937 3529 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15964-201ENSMUST00000138207 2745 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 B230303A05Rik-201ENSMUST00000220672 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Txk-202ENSMUST00000169534 2344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Kcns3-203ENSMUST00000217974 2314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Cd4-201ENSMUST00000024044 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm5134-201ENSMUST00000099577 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Havcr1-203ENSMUST00000109223 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm5893-201ENSMUST00000135286 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm37842-201ENSMUST00000192330 1569 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Patj-205ENSMUST00000107030 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm7457-201ENSMUST00000100821 2459 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Pde4b-201ENSMUST00000030251 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm6919-201ENSMUST00000180049 483 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm17800-201ENSMUST00000182466 971 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1700049E22Rik-201ENSMUST00000187986 507 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm29142-201ENSMUST00000188009 696 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms