Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Slc6a18-203ENSMUST00000109680 4052 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms