Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm25837-201ENSMUST00000158919 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC166358.1-201ENSMUST00000220677 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC153662.2-201ENSMUST00000221097 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC156037.2-201ENSMUST00000221284 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC166341.6-201ENSMUST00000221528 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 CT030242.1-201ENSMUST00000221945 125 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC124772.2-201ENSMUST00000222049 154 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC153663.1-201ENSMUST00000222165 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 CT030157.1-201ENSMUST00000222355 148 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC150661.2-201ENSMUST00000222418 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC127242.2-201ENSMUST00000223138 148 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC110236.1-201ENSMUST00000227807 527 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 817.1 ms