Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 4933407I05Rik-201ENSMUST00000213311 482 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20795J3QP49 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms