Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Tmx2-201ENSMUST00000053664 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Hdac5Q9Z2V6 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm13571-202ENSMUST00000151984 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Mir8110-201ENSMUST00000183771 97 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Zg16-202ENSMUST00000205424 682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hdac5Q9Z2V6 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms