Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Use1Q9CQ56 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms