Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Zfp398Q8BV16 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Zfp398Q8BV16 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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