Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NischQ80TM9 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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