Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 1700012A03Rik-201ENSMUST00000031778 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9999-201ENSMUST00000070660 486 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Rexo5-202ENSMUST00000084644 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 Gsta1-201ENSMUST00000098537 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgr2-201ENSMUST00000123614 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gtpbp6Q3U6U5 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms