Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q3U6N9 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms