Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccndbp1Q3TVC7 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccndbp1Q3TVC7 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccndbp1Q3TVC7 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccndbp1Q3TVC7 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms