Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
SrprbP47758 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms