Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
LtbP41155 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LtbP41155 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
LtbP41155 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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LtbP41155 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
LtbP41155 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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