Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
RxraP28700 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
RxraP28700 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms