Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Adh6a-201ENSMUST00000013455 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm43376-201ENSMUST00000198939 1887 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm43910-201ENSMUST00000204561 3241 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm42847-201ENSMUST00000201732 2553 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Sptan1P16546 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Col15a1-204ENSMUST00000107731 3253 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gstp3-201ENSMUST00000076451 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Fshb-201ENSMUST00000028533 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Slco1c1-206ENSMUST00000205214 2515 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 1700113B19Rik-201ENSMUST00000191817 420 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms