Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Atxn1-202ENSMUST00000167708 3751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc180J3QNE4 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc180J3QNE4 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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