Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ctsw-201ENSMUST00000025844 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Smim7-201ENSMUST00000058733 642 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Nps-201ENSMUST00000097983 840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Tdrd5-204ENSMUST00000167528 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Eps15-202ENSMUST00000102729 5190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Vsnl1-201ENSMUST00000072299 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm5120-201ENSMUST00000215231 2414 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm33630-201ENSMUST00000223038 2071 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Tmem144-202ENSMUST00000168038 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 B230303A05Rik-201ENSMUST00000220672 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC138284.3-201ENSMUST00000217345 4663 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 D630039A03Rik-201ENSMUST00000063816 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Pex5l-205ENSMUST00000108225 3109 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Cavin2-201ENSMUST00000051572 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm13710-201ENSMUST00000126679 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm16304-201ENSMUST00000129972 775 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm22893-201ENSMUST00000158637 116 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm24349-201ENSMUST00000158709 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm18538-201ENSMUST00000204265 484 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm28038F7BCN9 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms