Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prrt4B2RU40 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms