Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms