Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Runx1-207ENSMUST00000189679 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Napepld-201ENSMUST00000060899 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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