Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr6-202ENSMUST00000213552 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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