Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lypd8-201ENSMUST00000013787 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pabpn1-208ENSMUST00000172557 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm25301-201ENSMUST00000175285 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm7270-202ENSMUST00000195850 1131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm8605-201ENSMUST00000221619 1370 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Scel-202ENSMUST00000227322 2443 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Rab23-202ENSMUST00000115174 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pou2f1-201ENSMUST00000027850 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tifab-201ENSMUST00000169652 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr170-202ENSMUST00000206562 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gabpb2-203ENSMUST00000107204 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28095-201ENSMUST00000186343 1515 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm44874-201ENSMUST00000206586 1542 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 1700028E10Rik-203ENSMUST00000201142 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15532-201ENSMUST00000121192 884 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45227-201ENSMUST00000205585 169 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms