Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxc5P32043 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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