Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Ucn2-201ENSMUST00000052724 1155 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm10472-201ENSMUST00000193014 2102 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Magea2-201ENSMUST00000069477 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Trim21-201ENSMUST00000033264 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Ano4-208ENSMUST00000182613 3880 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Parva-203ENSMUST00000106643 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm12003-201ENSMUST00000118518 1105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm27651-201ENSMUST00000183465 246 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm10120-201ENSMUST00000219845 357 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm2035J3QP87 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms