Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm8682-201ENSMUST00000121310 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms