Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 5730435O14Rik-202ENSMUST00000170047 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm6072-201ENSMUST00000203989 496 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mrps36-ps1-201ENSMUST00000061311 306 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr770-201ENSMUST00000062314 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm15646-201ENSMUST00000143317 766 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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