Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Rnft1Q9DCN7 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rnft1Q9DCN7 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms