Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc50Q810U5 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc50Q810U5 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms