Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Sdr16c5-201ENSMUST00000040925 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm26288-201ENSMUST00000104168 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Rpl7l1-ps1-201ENSMUST00000118822 725 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Pax4-205ENSMUST00000174194 974 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm9711-201ENSMUST00000208857 327 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm18942-201ENSMUST00000213578 1121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC161117.2-201ENSMUST00000221908 451 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC154687.1-201ENSMUST00000224875 677 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC127562.1-201ENSMUST00000226174 572 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC133156.2-201ENSMUST00000226865 784 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AC122821.1-201ENSMUST00000228934 705 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Dhcr7-201ENSMUST00000073878 2815 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Lcp1-202ENSMUST00000124499 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Zc3hav1-204ENSMUST00000143702 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm38275-201ENSMUST00000193293 1532 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 1700108F19Rik-205ENSMUST00000190818 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Usp28-201ENSMUST00000047349 4133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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Znf48Q3US17 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm13021-201ENSMUST00000135716 407 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Rgs5-202ENSMUST00000152809 723 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Gm17748-201ENSMUST00000177906 522 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Znf48Q3US17 4930500F10Rik-201ENSMUST00000180701 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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