Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ttc21bQ0HA38 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms