Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Qrich2-204ENSMUST00000208602 7260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Siah1bQ06985 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms