Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Apoh-201ENSMUST00000000049 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 BC025920-203ENSMUST00000119753 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mad2l1-201ENSMUST00000101343 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm5862-201ENSMUST00000072286 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Sorbs1-204ENSMUST00000165469 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm17259-201ENSMUST00000181520 4608 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Slc29a3-202ENSMUST00000119595 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14273-201ENSMUST00000136315 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gja1-201ENSMUST00000068581 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Vmn2r53-201ENSMUST00000170412 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 n-R5s165-201ENSMUST00000104074 100 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 E330017L17Rik-204ENSMUST00000145196 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ppp1r2-ps7-202ENSMUST00000185057 763 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Tmem52b-204ENSMUST00000204741 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45824-201ENSMUST00000212236 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC164105.1-202ENSMUST00000213920 999 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Fxyd2-201ENSMUST00000041005 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Nbr1-205ENSMUST00000107212 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gmfb-202ENSMUST00000111817 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gmfb-201ENSMUST00000079314 4171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC153364.1-201ENSMUST00000220081 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Zbtb44-206ENSMUST00000217092 2472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gatad2b-201ENSMUST00000049382 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 A430033K04Rik-202ENSMUST00000069862 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 4632432E15Rik-201ENSMUST00000191824 2439 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Wdhd1-202ENSMUST00000111792 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Rtkn2-204ENSMUST00000118160 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mettl6-209ENSMUST00000228727 2388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ablim1-205ENSMUST00000111526 2164 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Igkv2-112-202ENSMUST00000103319 358 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms