Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ube3bQ9ES34 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ube3bQ9ES34 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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