Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Nipal4-201ENSMUST00000020679 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Zfp275-202ENSMUST00000114499 6284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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