Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pip5k1bos-201ENSMUST00000126936 684 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38358-201ENSMUST00000195144 428 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm8850-201ENSMUST00000195316 588 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Snora61-201ENSMUST00000083015 130 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Clnk-201ENSMUST00000169819 1700 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Clnk-202ENSMUST00000171633 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11730-202ENSMUST00000147186 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tssk4-203ENSMUST00000226497 1235 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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