Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Pinc-201ENSMUST00000190229 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
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