Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12989-201ENSMUST00000122331 731 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm16310-201ENSMUST00000124376 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm16212-201ENSMUST00000136190 282 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Scamp1-204ENSMUST00000153558 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC156164.1-201ENSMUST00000216958 225 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm16026-206ENSMUST00000163068 2741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Serpina3j-201ENSMUST00000109957 2155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pdik1l-202ENSMUST00000105876 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm28989-201ENSMUST00000187867 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Fam19a3-201ENSMUST00000139783 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pabpc6-201ENSMUST00000057190 3208 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Otog-202ENSMUST00000209802 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ube2k-205ENSMUST00000201383 1553 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Optn-201ENSMUST00000027986 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm33630-201ENSMUST00000223038 2071 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Afp-201ENSMUST00000042755 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Fanca-201ENSMUST00000035495 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Sp100-202ENSMUST00000066427 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtbrP50284 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Timeless-203ENSMUST00000105242 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 9330104G04Rik-202ENSMUST00000205647 1943 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm11537-201ENSMUST00000124865 791 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LtbrP50284 Gm14532-201ENSMUST00000156115 279 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm37539-201ENSMUST00000192644 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtbrP50284 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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