Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Abca8a-201ENSMUST00000046223 5614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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