Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC099612.1-201ENSMUST00000226318 1636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC164625.1-201ENSMUST00000214034 3036 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37309-201ENSMUST00000194994 1639 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms