Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm5590-201ENSMUST00000059110 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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H2-Eb1P04230 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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