Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Use1Q9CQ56 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Use1Q9CQ56 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Use1Q9CQ56 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Use1Q9CQ56 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Use1Q9CQ56 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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