Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rnase13-201ENSMUST00000089771 1412 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ntpcr-208ENSMUST00000152189 822 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms