Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Srbd1-201ENSMUST00000095187 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Net1-202ENSMUST00000099946 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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