Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Cd28P31041 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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