Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RxraP28700 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RxraP28700 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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