Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 9530020I12Rik-202ENSMUST00000218368 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28229-201ENSMUST00000188747 2153 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mitf-203ENSMUST00000101123 2144 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mitf-204ENSMUST00000113339 2144 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm3854-201ENSMUST00000207173 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Arpc3-204ENSMUST00000111716 838 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45353-201ENSMUST00000210581 252 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms