Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm38306-201ENSMUST00000193954 237 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Igkv12-42-201ENSMUST00000198769 327 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm18058-201ENSMUST00000207385 492 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44714-201ENSMUST00000208665 657 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm30781-201ENSMUST00000204743 216 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11756-201ENSMUST00000107310 1312 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm5975-201ENSMUST00000185256 1399 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms