Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Acbd5-202ENSMUST00000114523 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf17Q99MV7 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Rcbtb2-209ENSMUST00000164822 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf17Q99MV7 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms